訪(fǎng)問(wèn)鏈接:http://portals.broadinstitute.org/ctrp/
數據庫簡(jiǎn)介:
癌癥治療反應門(mén)戶(hù)(The Cancer Therapeutics Response Portal,CTRP)將癌癥細胞系的遺傳、譜系和其他細胞特征與小分子敏感性聯(lián)系起來(lái),目的是加速發(fā)現與患者匹配的癌癥治療方法。
這一重要的資源推動(dòng)發(fā)現與患者群體相匹配的潛在癌癥藥物,使患者最大可能從中受益。CTRP這一門(mén)戶(hù)網(wǎng)站涵蓋了70,000個(gè)癌細胞系化合物敏感性和遺傳或譜系特征之間的聯(lián)系,作為一個(gè)公共資源供世界各地的研究人員所用。研究人員可利用這一數據集來(lái)尋找不同癌癥類(lèi)型可供利用的治療脆弱點(diǎn)。
研究人員生成了一個(gè)481個(gè)小分子探針和藥物的信息集,這些探針和藥物選擇性地瞄準細胞回路中的不同節點(diǎn),并共同調節廣泛的細胞過(guò)程。研究人員定量測量了860個(gè)深具特征的癌細胞系對告密化合物的敏感性,并進(jìn)行了與癌癥特征相關(guān)的敏感性分析,包括突變、基因表達、拷貝數變異和譜系。這些分析以及到底層數據的鏈接都是在CTRP上公開(kāi)提供的。
CTRP包含信息中的這些細胞系來(lái)自許多不同種類(lèi)的腫瘤,另一項稱(chēng)作為癌細胞系百科全書(shū)(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互補研究已經(jīng)確定了這些細胞系的基因組特征。在美國國家癌癥研究所癌癥靶點(diǎn)發(fā)現和開(kāi)發(fā)(CTD2)項目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共數據,其中包含了有關(guān)每個(gè)癌細胞系突變、基因表達和其他基因組改變的信息。
CTRP是生物醫學(xué)研究界的一個(gè)活資源,可以開(kāi)發(fā)出對小分子作用機制和新的治療假設的見(jiàn)解,并支持未來(lái)根據預測性生物標記物發(fā)現與患者匹配的藥物。
參考資料:
An Interactive Resource to Identify Cancer Genetic and Lineage Dependencies Targeted by Small Molecules
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867413009604
如有問(wèn)題,可聯(lián)系:
資源建設部: 葛老師 025-86185504 getao@cpu.edu.cn